Пирролизин
Пирролизин — это природная аминокислота, кодируемая генами некоторых метаногенных архей. Пирролизин входит в состав некоторых ферментов метаболизма метана.
Пирролизин является производным аминокислоты лизина и кодируется кодоном UAG (обычно 'amber' стоп-кодоном). Возможно, модифицируется в случае наличия специфической последовательности нуклеотидов PYLIS, которая образует стебелек и петлю в структуре мРНК, усиливая включение пирролизина вместо терминации трансляции. Кодон UAG используется реже, чем другие стоп-кодоны, и, если встречается в открытой рамке считывания, за ним, как правило, следуют другие стоп-кодоны.
Пирролизин
Рядом с кластером генов переноса метильной группы археи Methanosarcina barkeri располагается ген pylT, который кодирует необычную тРНК с антикодоном CUA. Соседний ген pylS кодирует аминоацил-тРНК-синтетазу второго класса, которая присоединяет пирролизин к тРНК-продукту гена pylT. Оперон, содержащий гены pylT и pylS также найден в геномах других секвенированных представителей семейства Methanosarcinaceae. Гомологи генов pylS и pylT обнаружены также в грам-положительной бактерии Desulfitobacterium hafniense, хотя функции этих гомологов у данной бактерии неизвестны.
Первоначально было показано, что продукт гена pylT — тРНК с антикодоном (CUA), может быть «заряжена» аминокислотой лизином с помощью белка PylS. Относительно недавно было показано, что тРНК с аниткодоном CUA может быть «заряжена» лизином в условиях in vitro последовательным взаимодействием с лизиновыми тРНК-синтетазами первого и второго класса из M. barkeri. Последние данные указывают на то, что происходит прямое присоединение пирролизина к тРНК с антикодоном CUA при помощи белкового продукта гена pylS. Это означает, что пирролизин представляет собой 22ую аминокислоту, закодированную генетически.
Для обозначения пирролизина ИЮПАК рекомендует трехбуквенное сокращение Pyl и однобуквенное O.
См. также
- Генетический код
- Трансляция
- Селеноцистеин, 21ая генетически закодированная аминокислота
Примечания
- John F. Atkins and Ray Gesteland (2002). "The 22nd Amino Acid". Science 296 (5572): 1409–1410. DOI:10.1126/science.1073339. PMID 12029118.
- Krzycki J (2005). "The direct genetic encoding of pyrrolysine". Curr Opin Microbiol 8 (6): 706–712. DOI:oi:10.1016/j.mib.2005.10.009. PMID 16256420.
Внешние ссылки
Аминокислоты |
|
|---|---|
| Стандартные аминокислоты | Аланин · Аргинин · Аспарагин · Аспарагиновая кислота · Валин · Гистидин · Глицин · Глутамин · Глутаминовая кислота · Изолейцин · Лейцин · Лизин · Метионин · Пролин · Серин · Тирозин · Треонин · Триптофан · Фенилаланин · Цистеин |
| Нестандартные аминокислоты | Пирролизин · Селеноцистеин · Цитруллин · 4-гидроксипролин · 5-гидроксилизин · Десмозин · N-метиллизин |
| Близкие по структуре соединения | Таурин |
|
| |
| Альфа-спираль | Это незавершённая статья по биохимии. Вы можете помочь проекту, исправив и дополнив её. |
Эта страница использует содержимое раздела Википедии на русском языке. Оригинальная статья находится по адресу: Пирролизин. Список первоначальных авторов статьи можно посмотреть в истории правок. Эта статья так же, как и статья, размещённая в Википедии, доступна на условиях CC-BY-SA .
